卢沟桥事变爆发后的第二天，东京海军军令部电令第三舰队司令官长谷川清，立即率第三舰队主力从台湾海峡驶回原“警戒防地”上海、青岛、厦门等港口“警戒”备战。长谷川清随旗舰出云号返抵上海港。
7月16日，第三舰队司令官长谷川清在上报东京海军当局的《对华作战用兵意见书》中提出：“欲置中国于死命，以控制上海和南京最为重要。”
7月28日上午，汉口的日本侨民突然奉命实行紧急撤退。此事的直接起因，是日本驻南京总领事馆在7月27日晚获得黄浚(即黄秋岳，时任国民政府行政院秘书，为日本方面秘密收买充当间谍)所提供的情报：中国将立即封锁江阴长江航道，歼击日本海军驻泊长江各口岸的军舰。
7月29日日本联合舰队司令长官永野修身发布“第一号作战命令”，第一舰队主力驶往上海，同日，日本政府下令撤退长江沿岸汉口等各个城市的侨民。
8月8日，长谷川清根据东京的指示，为应付事态扩大作好一切准备，向部队下达了正式的作战部署。8月9日，日本在长江一带的侨民29230人全部撤退至上海。同时，上海日侨全部撤入上海租界地域，集中虹口、杨树浦地区。
8月13日至19日，集中上海的日侨除留下1万多人外，悉数撤回日本。从日本的战场作战的部署而言，陆军当时正倾注全力进行平津作战，力图尽快解决华北问题，海军在上海暂时采取蓄而不发的态度，以待整个事态的发展。
9日晚，虹桥机场案发，当晚21时30分，长谷川清即下令在日本佐世保待命的第八战队、第一水雷队、第一航空队、佐世保镇守府第一特别陆战队、吴港镇守府第二特别陆战队，作好出动准备。8月10日13时许，电令上述部队之大部迅速向上海开进。
8月11日，上述部队到达上海，当晚23时其陆战队2000人登陆完毕。同日，蒋介石下令京沪警备军进军上海，发动对驻沪日军的围攻战。
8月12日下午，淞沪停战六国共同委员会应日本代表冈本季正的要求，召集紧急全体会议。会上冈本公然污蔑中国保安队和军队在《淞沪停战协定》之限制区域内推进作战准备，不仅妨碍租界安全，且违反停战协定，他要求各国采取有效方法，对中国加以制裁。中方代表俞鸿钧据理逐条予以反驳。
8月13日，张治中奉命指挥精锐的中央警卫军(第87师、第88师、独立第20旅等部)向日军开战，围攻日军，淞沪会战打响。他率陆战队支持了10天，还召唤日本海军航空队进行越洋轰炸，终于等来了松井石根率领的2个师团的援军。后来在攻略南京时，发生了美国炮艇帕纳伊号和英国军舰被击沉的事件，他虽然立即赔礼道歉，但这还是作为日后他甲级战犯嫌疑的重大依据，1938年(昭和13年)4月25日长谷川清解职调任横须贺镇守府司令长官
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长谷川清